NCTS (New Computerised Transit System) to system informatyczny obsługujący wspólnotową procedurę tranzytu na terenie Unii Europejskiej oraz wspólną procedurę tranzytową WPT.

Decyzja o wdrożeniu systemu NCTS została podjęta przez kraje uczestniczące w konwencji WPT w 1994 roku. Polska uczestniczy w NCTS od 1 maja 2004 r.

Celem  systemu NCTS jest pełne skomputeryzowanie obsługi tych procedur, tak aby informacje o tranzycie były przechowywane, przekazywane i przetwarzane w ramach systemu informatycznego - od momentu złożenia zgłoszenia celnego do zamknięcia procedury tranzytowej. Każda operacja tranzytowa ma nadawany numer MRN (Movement Reference Number) i w ramach systemu jest identyfikowana właśnie po tym numerze.

System NCTS cały czas ulega zmianom. Pojawiają się jego kolejne wersje. W roku 2024 ma zostać wdrożony nowy system NCTS2 PLUS. Będzie to duża zmiana idąca w kierunku unifikacji procedur w Unii Europejskiej.